會查的。

目錄是由正文里的標題產生的，查正文的時候會查標題；

參考文獻重復一些是沒問題的，不能重復太多，比如90%都一樣就不行。

這個要看你學校具體要求的，你學校要檢測哪些就上傳哪些，盡量和學校查重內容保持一致，這樣檢測的才一致。不過目錄和參考文獻在學校查重系統可以識別的，只要你的格式正確，系統可以自動剔除不算重復的。查重可以直接到圖書館查重，也可以到一些知網自助查重網站：學術不端網、PaperEasy、螞蟻查重網等，全程自助安全！快速！